Die folgenden Optionen werden beim Aufruf von Niki unmittelbar hinter den Befehl und vor den X-Optionen angegeben (NikiAufruf):

Niki -NikiOptionen -Xoptionen ...

Sowohl die NikiOptionen als auch die X-Optionen sind optional.

Die Reihenfolge der NikiOptionen ist von Bedeutung. Eine durch eine vorangehende Option eingeschaltete Funktion kann durch eine nachfolgende wieder ausgeschaltet werden und umgekehrt.

-call druckt NikiOptionen auf STDOUT und beendet Niki

-slim schlanke GUI ohne Verzeichnis-Dialog, kein Kontext-Browser, keine Nikis im Kontext-Browser

-context Kontext-Browser anzeigen

-contextnikis Nikis im Kontext-Browser anzeigen

-html Das Niki als HTML auf STDOUT ausgeben

-export Export-Elemente anzeigen

-print Durck-Steuer-Element anzeigen

-version gibt aktuelle NikiVersion auf STDOUT aus und beendet Niki

-external gibt die assozierten externem Programme aus und beendet Niki

-configuration erzeugt eine neue Konfigurations-Datei ~/.niki.conf. Die alte Konfiguration wird einbezogen.